尿路上皮癌としても知られる移行細胞癌(TCC)は、ヒトとイヌで最も多い膀胱癌です。ヒトのTCCの約4分の1は筋層に浸潤し、転移による死亡リスクが高いとされている。犬のTCC(cTCC)は、典型的に高悪性度で筋浸潤性の腫瘍である。危険因子、病理組織、臨床症状に共通点があることから、cTCCは、ヒトの筋層浸潤性TCCの治療法に役立つ新規治療法を評価するためのモデルとなる可能性がある。本研究の目的は、分子レベルでのcTCCの特徴を明らかにし、発がんの促進因子と治療標的を特定することであった。我々は、11のcTCC腫瘍と3つのマッチした正常サンプルの全エクソームシーケンス(WES)を行い、タンパク質をコードする遺伝子に583のバリアントを同定した。最も多かった変異は、BRAFのV-to-Eミスセンス変異で、11サンプル中4サンプル(36%)でWESにより同定された。サンガーシークエンスにより、同じ11検体中8検体、および32検体のFFPE(フォルマリン固定パラフィン包埋)CTCCサンプル中22検体でBRAFの変異が同定され、全体の有病率は70%であることが示唆された。RNA-Seqを用いて、cTCC腫瘍と正常な膀胱組織の遺伝子発現プロファイルを比較したところ、cTCC腫瘍では、細胞周期、DNA修復、抗ウイルス免疫に関わる遺伝子の発現が上昇していました。また、免疫遺伝子シグネチャーと免疫組織化学的分析を用いて、cTCCの免疫ランドスケープを分析した。腫瘍のサブセットは、ホットな腫瘍微小環境の特徴を持ち、ヒト膀胱がんにおけるPD-1/PD-L1遮断薬の完全奏効に関連するシグネチャーの高い発現を示した。