飼い犬の重要な死亡原因である犬のがんは、ヒトのがんの強力な比較モデルとなっている。犬のがんの発がんを促進する遺伝子変化を明らかにすることは、がん生物学の理解を深め、治療法を開発し、犬と人の両方のがん管理を改善するための大きな可能性を秘めています。次世代シーケンサー（NGS）を用いた診断パネルは、臨床的に有効な変異を同定するためにヒトの腫瘍学分野で日常的に使用されており、個々の変異プロファイルに基づいたオーダーメイドの治療を可能にしている。ここでは、ハイブリダイゼーション・キャプチャー・ベースのターゲットNGS法を用いて、包括的な犬のがん遺伝子パネル「Canine Oncopanel」を開発したことを報告する。Canine Oncopanelは、283のがん遺伝子のディープシーケンスを可能にし、これらの遺伝子内の体細胞変異を検出することができる。また、ヒトの癌領域における類似の癌パネルの評価基準をベンチマークとし、堅牢で高水準の性能を達成するために徹底した最適化を行いました。Canine Oncopanelは、既知の変異を持つ基準となる腫瘍サンプルを用いて検証を行った結果、別の方法で同定された変異を高い精度と感度で検出できることが実証されました。推定ドライバーは臨床サンプルの90％以上で検出され、高い感度を示しました。Canine Oncopanel は、犬の一般的ながん種と希少ながん種の変異プロファイルをマッピングし、推定ドライバー変異を特定するのに適しています。Canine Oncopanelで得られたデータは、がんの原因となる推定上のドライバー変異と臨床的に関連する潜在的なマーカーの豊富なリソースを示しており、犬のがんにおける個別化診断と精密医療への道を開くものです。
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