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Wednesday, December 25, 2024
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犬の辺縁帯リンパ腫と濾胞性リンパ腫のトランスクリプトーム、メチルーム、コピー数異常データの統合解析

限界帯リンパ腫(MZL)と濾胞性リンパ腫(FL)は、犬の低悪性度B細胞リンパ腫に分類される。犬の低悪性度B細胞リンパ腫の一つである。我々は、トランスクリプトーム、ゲノム全体のDNAメチル化、コピー数異常の解析を統合して、犬のMZL(n = 5)とFL(n = 7)の病因を明らかにし、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)と比較した。トランスクリプトームプロファイリングの結果、BCRやTLRのシグナル伝達経路など、両組織型に共通する生物学的プロセスの存在が明らかになった。しかし、FLはE2F標的の濃縮を示したのに対し、MZLはMYCによる転写活性化の特徴を示した。FLはCEACAM23と24を含むchr1に特徴的な欠損を示したが、逆にMZLはMYCが存在するchr13に複数の反復した欠損を示した。メチル化ピークの分布は、2つのタイプの間で類似していた。3つのオミックスから得られたデータを統合すると、FLはMZLやDLBCLのデータセットから明確に分離された。MZLは、FoxM1ネットワークとTLR関連のTICAM1依存のIRFs活性化経路の濃縮を示した。しかし、MZLとDLBCLを区別する特定のシグネチャーはなかった。結論として、本研究は、犬のFLおよびMZLの分子的およびエピジェネティックな病因を初めて包括的に解析したものである。

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