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Friday, December 27, 2024
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犬のメラノーマに異常に発現したsnoRNA、snRNA、piRNA、tRF

低分子ノンコーディングRNA(sncRNAs/sRNAs)のうち、マイクロRNA(miRNA)の機能制御については、犬の口腔内メラノーマ(COM)で研究されている。しかし、small nucleolar RNA(snoRNA)、small nuclear RNA(snRNA)、transfer RNA-derived fragments(tRF)、PIWI-interacting RNA(piRNA)など、その他のsncRNAのCOMにおける発現レベルは不明である。本研究の目的は、我々が実施しているsmall RNA sequencingプロジェクト(PRJNA516252)から、COMにおけるmiRNA以外のsncRNAを調査することであった。その結果、COMではいくつかのsnRNAとpiRNAが上昇し、tRFとsnoRNAは低下していた。犬のメラノーマ組織と細胞株において、U1 snRNAとpiR-972の発現上昇、tRNA-ser (1)とsnoRA24の発現低下が定量的逆転写PCR法により確認された。同様に、COM症例の血漿中のtRNA-ser (1)とsnoRA24の発現も低下していた。最後に、ヒト表皮メラノサイト細胞(HEMa-Lp)と比較して、ヒト皮膚メラノーマ細胞株(MEWO)では、U1とsnoRA24の発現傾向が同様であることを発見しました。今回の研究では、メラノーマの進行に伴い、snRNA、snoRNA、tRF、piRNAの発現が異常になっていることがわかりました。さらに、メラノーマに関連するU1とsnoRA24の発現は、ヒトとイヌのメラノーマで類似していた。

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